Comme de nombreux Sith, Exar Kun a tout d'abord été un Jedi. Kun était ainsi le Padawan du maître Jedi Vodo-Siosk Baas sur la planète Dantooine. Curieux de nature, il étudia en secret un des Holocrons de son maître et découvrit en partie l'histoire des Sith. Déjà à l'époque, il n'appréciait pas trop le fait que son maître et ses deux camarades étudiants, Crado et Sylvar, ne soient pas Humains et se moquent parfois de lui. Au cours d'un entraînement au Sabre laser, il faillit tuer Sylvar et Vodo dut intervenir pour calmer les esprits. Il proposa à Exar de se battre contre lui mais le maître Jedi prit pour toute arme un simple bâton de marche. Vodo était sur le point de défaire son disciple lorsque celui-ci utilisa La Force pour attraper le sabre de son maître, briser son bâton et sortir victorieux du combat. Après cette épreuve difficile, Kun eut bien du mal à conserver ses esprits et à ne pas laisser libre cours à sa colère débordante. Il quitta Dantooine peu après et, hanté par le pouvoir des Sith, décida de se rendre sur Onderon, où l'esprit de l'ancien Seigneur Sombre Freedon Nadd se révéla à lui. Fasciné par l'apparente toute puissance du Coté Obscur, Kun vit naître en lui le désir ardent de l'étudier encore plus.