Les deux Sith firent alors de nombreux adeptes dans le but de voir 
la suprématie de l'Ordre Sith. Ils organisèrent un fantastique 
assaut sur l'Académie Jedi d'Ossus et ramenèrent de nombreux 
nouveaux apprentis, tels Oss Willum et Crado, qu'ils entraînèrent 
grâce un Holocron Sith pour tuer leurs maîtres Jedi et renverser 
l'Ordre. Les Jedi réagirent et décidèrent alors de contrer la 
menace des Sith. Ils formèrent un groupe d'assaut composé de 
milliers de serviteurs de La Force, afin d'en finir une fois pour 
toutes : ce fut la Grande Guerre des Sith. Kun et Qel-Droma 
causèrent la mort de millions de personnes, mais ce dernier fut 
capturé sur Coruscant et préparé pour son jugement. Exar vola à 
la rescousse de son apprenti, mit toute la Cour en animation 
suspendue et tua bon nombre d'officiels républicains, plus son 
ancien maître Vodo. Puis il attaqua à nouveau Ossus pour voler le 
savoir de l'immense Bibliothèque mais échoua lorsque son disciple 
Aleema détruisit maladroitement tout le système Cron à l'aide 
d'une super-arme mal maîtrisée. Il battit donc en retraite sur 
Yavin IV pour retrouver ses forces. La fin de la guerre fut 
précipitée par la capture de Qel-Droma sur Ossus par maître Thon. 
Coupé de La Force par une Jedi nommée Nomi Sunrider, Ulic chercha 
la rédemption et trahit son maître en révélant aux Jedi l'endroit 
où Kun se cachait et tirait son pouvoir, c'est-à-dire Yavin IV.

Les Jedi sortirent victorieux de ce titanesque affrontement, mais 
Exar Kun eut le temps d'intégrer son esprit aux ruines des temples 
Massassi à l'insu des Jedi et seul son corps fut détruit. Il 
patienta durant plusieurs longs millénaires, abreuvant son obscur 
pouvoir de l'énergie vitale de ses guerriers Massassi. Et ce n'est 
qu'au bout de plus de quatre mille ans, au temps où le maître Luke 
Skywalker dirigeait l'Academie du Nouvel Ordre Jedi sur Yavin IV, 
que le Seigneur Sith à l'esprit latent décida de frapper à nouveau.